دانلود ترجمه مقاله پایداری دارویی در واکنش های مربوط به lncRNA و mRNA در ۱۹ نوع سرطان – الزویر ۲۰۱۹:ما در ابتدا موقعیت درمان دارویی را به عنوان خط سلول در سرطان درمان شده با یک دارو تعریف کردیم. برای هر کدام از موقعیت ها، یک خط سلول به عنوان خط سلول مقاوم در داروی خاص در نظر گرفته می شود اگر مقدار IC50 بیشتر از مقدار میانگین ۰٫۸ برای SD تمام خطوط سرطانی باشد). به عبارت دیگر، خط سلول دارای مقدار IC50 کمتر از مقدار میانگین منهای SD به عنوان خط سلول حساسیت دارویی در نظر گرفته می شود. علاوه بر این، تعداد خطوط سلولی مقاوم و حساس نباید کمتر از سه برای هر موقعیت باشند. بنابراین، ۷۵۸ موقعیت دارای معیار بالا هستند که در برگیرنده ۱۹ نوع سرطان و ۱۳۸ دارو می باشند (جزئیات در S3). تعداد نهایی خطوط سلولی مقاوم و حساس برای ۱۹ سرطان در جدول ۲ نشان داده شده اند.

مقاله انگلیسی+ترجمه فارسی

فهرست مطالب

مقدمه

نتایج

شبکه ها و الگو های ceRNA

الگو های مهم مرتبط با مقاومت دارویی

تحلیل پان دراگ در الگو های مهم در LUAD

تحلیل پان کانسر برای الگو های مهم باسوتینیب

مطالعه موردی مکانیزم های احتمالی ceRNA در مقاومت داروئی

بحث

مواد و روش

گرداوری اطلاعات و پیش پردازش

ساختار شبکه ceRNA

شناسایی الگو ها در شبکه ceRNA

شناسایی خطوط سلول مقاوم در برابر دارو و حساسیت های دارویی

شناسایی الگو های مهم مرتبط با مقاومت دارویی

تحلیل کاربردی الگو های مهم

دسترسی به اطلاعات و مواد

منابع

مقدمه

مقاومت دارویی یکی از دلایل رایج عدم موفقیت درمان در درمان های سرطان است و مکانیزم های مولکولی نیازمند بررسی بیشتر هستند. RNAs (ceRNAs) درون زای رقیب می توانند از طریق مشارکت در فرایندهای مختلف زیست شناسی بر واکنش دارویی تاثیر گذار باشند، از جمله این فرایندها می توان به تنظیم نوع سلول، انتقال سیگنال و غیره اشاره کرد. در این تحقیق، ما به بررسی سیستماتیک مقاومت از چشم انداز الگو های ceRNA پرداخته ایم. در ابتدا، یک شبکه عمومی از ceRNA ساخته ایم که در برگیرنده ۸۳ RNA بلند بدون کد (lncRNAs) و ۳۷۹ mRNAs می باشد. سپس، الگو های مقاومت دارویی را برای ۱۳۸ دارو و ۱۹ نوع سرطان شناسایی کردیم که مجموع آنها ۷۵۸ موقعیت دارویی سرطان را شامل می شوند. تحلیل عملکرد نشان داد که فرایندهای زیست شناسی مقاومت دارویی در این الگو ها زیاد اتفاق می افتند. تحلیل های پان دراگ و پان کانسر نشان دهنده الگو های مشابه و ویژه برای داروها و سرطان های متفاوت می باشند. به علاوه، ما پی بردیم که جفت های دارویی دارای الگو های مشترک دارای ساختار یکسان هستند که این عامل دلالت بر ریسک بالای مقاومت چند دارویی (MDR) دارد. در نهایت، ما پیش بینی می کنیم که ceRNA جفت شده با GAS5-RPL8 می تواند مقاومت دارویی را تنظیم کند زیرا بیان پایین GAS5 باعث افزایش بازدارندگی میکرو RNA (miRNA)- در RPL8 می شود. در مجموع، ما به بررسی مقاومت دارویی از طریق استفاده از الگو های ceRNA پرداخته ایم و بیان کردیم که الگو های ceRNA می توانند شاخص های جدید برای مقاومت دارویی باشند و دلالت بر وجود مکانیزم جدید دارند

Drug

resistance is a common cause of treatment failure in cancer therapy, and molecular mechanisms need further exploration. Competing endogenous RNAs (ceRNAs) can influence drug response by participating in various biological processes, including regulation of cell cycle, signal transduction, and so on. In this study, we systematically explored resistance from the perspective of ceRNA modules. First, we constructed a general ceRNA network, involving 83 long non-coding RNAs (lncRNAs) and 379 mRNAs. Next, we identified the drug resistance-related modules for 138 drugs and 19 cancer types, totaling 758 drug-cancer conditions. Function analysis showed that resistance-related biological processes were enriched in these modules, such as regulation of cell proliferation, DNA damage repair, and so on. Pan-drug and pan-cancer analyses revealed some common and specific modules across multiple drugs or cancers. In addition, we also found that drug pairs with common modules have similar structure, indicating high risk for multidrug resistance (MDR). Finally, we speculated that ceRNA pair GAS5-RPL8 could regulate drug resistance because low expression of GAS5 would enhance microRNA (miRNA)-mediated inhibition of RPL8. In total, we investigated the drug resistance by using ceRNA modules and proposed that ceRNA modules may be new markers for drug resistance that indicated a possible novel mechanism.

نمونه ترجمه مقاله:دانلود ترجمه مقاله پایداری دارویی در واکنش های مربوط به lncRNA و mRNA در ۱۹ نوع سرطان

مقاومت در برابر شیمی درمانی معمولا در فرایندها درمان سرطان اتفاق می افتند (1). درک این مکانیزم مناسب نیست و راه حل موجود کافی نمی باشد. پیش از این، بیان شده بود که بسیاری از ژن ها  از طریق تاثیر گذاری بر الگو مقاومت دارویی مثل افزایش توانایی برای ترمیم صدمات DNA ، تغییر تکثیر و غیره  به مقاومت دارویی  کمک می کنند(2). برای نمونه، تنطیم زیاد NEK2  از طریق ایجاد میکرو لوله ها با مقاومت سیسپلاتین در فازS و G2 در چرخه سلول در سرطان تخمدان مرتبط می شود (3). FOXM1 به صورت مستقیم باعث فعال شدن ABCG2 برای افزایش فعالسازی دارویی و افزایش مقاومت دارویی در سرطان مثانه می شود (4). به علاوه، اخیرا RNAs (lncRNAs) بلند بدون کد در تحقیقات زیست پزشکی مورد بررسی قرار گرفته اند. این فاکتورها نقش مهمی در تنظیم تکثیر، تمایز، زایش، نوع سلول و غیره ایفا می کنند (5و6) و با مقاومت دارویی در سرطان مرتبط می باشند(7-8). برای نمونه، درمان جمتیباسین باعث مقاومت در سلول های ریشه ای سرطان پانکراس از طریق القای lncRNA HOTAIR می شود (9). بیان بیش از اندازه lncRNA UCA1 با مقاومت در برابر سیسپلاتین در ارتباط است (10).

lncRNAs از فعالیت های آنها از طریق مکانیزم های مختلفی چون تاثیر گذاری بر مدلسازی مجدد کروماتیک، کنترل انتقال و بیان و همچنین رقابت برای ایجاد پیوند میکرو RNA (miRNA)  با mRNAs استفاده می کنند (11-12). بنابراین، lncRNAs می تواند به عنوان RNAs (ceRNAs) درون زا برای تنظیم بیان ژن از طریق اشتراک عناصر miRNA با mRNAs عمل کند. بسیاری از تحقیقات بیان کردند که ceRNA ها در فرایند توسعه و درمان بیماریها حضور دارند (13-15).

اخیرا، تعداد زیادی از تحقیقات تلاش کرده اند تا مقاومت دارویی مرتبط با تعاملات ceRNA را برای نوع خاصی از سرطان مورد بررسی قرار داده اند. برای نمونه، lncRNA CASC2 باعث تنظیم PTEN به عنوان فاکتوری از miR-21 می شود و نقش مهمی در آسیب پذیری سرطان گردن و حساسیت در برابر سیسپلاتین می شود (16). lncRNA TUG1 از طریق  محور  miR-186/CPEB2بر مقاومت متوترکسات به عنوان فاکتور ceRNA تاثیر گذار باشد (17). به هر حال، تحلیل واحدی از ceRNA در مقاومت دارویی در انواع مختلف سرطان و برای بسیاری از داروها وجود ندارد. در این تحقیق، ما ابتدا یک شبکه ceRNA ساخته ایم که با توجه به آن الگو های مختلف مقاومت دارویی در 758 موقعیت را شناسایی کردیم ( یک موقعیت به این معناست که نوع خاص سرطان با داروی خاص درمان شده است). سپس، الگو های مهم و خاص را در موقعیت های مختلف بررسی کردیم ( نمودار جریان فرایند در شکل 1 نشان